Druga część bezpośrednio kontynuuje wydarzenia z "Pierwszego starcia". Po zwycięskiej batalii nad Ugh-Zanem III, Sam "Serious" Stone odlatuje statkiem kosmicznym SSS Centerprice w kierunku Syriusza. Pech chce, że niebawem musi on lądować awaryjnie w paśmie górskim Sierra De Chiapas, położonym w Ameryce Południowej. Od tej pory Sam jest zdany wyłącznie na siebie. Pomocny okaże się pokaźny arsenał broni wzbogacony o piłę łańcuchową, karabin snajperski i miotacz ognia. Zamiast egipskich piramid, tym razem nasz bohater będzie przemierzał krainę Majów, Babilon i tereny średniowiecznej Europy.